26 Ocak 1940 tarihinde Ankara’da doğmuştur.

Asıl adı Ayten Kaçmaz’dır. Çocukluğu Ankara’da geçti. Babasının lokantası vardı. Bir abisi ve Yıldız adında bir ablası vardır. 2 yaşındayken anne babası boşanmış. Annesi başkasıyla evlenince, babası da yeniden ilk karısı ile tekrar evlenmiş ve Ayten ile kardeşleri orada büyümüş.

1952 yılında Ankara Devlet Konservatuarı’nın bale bölümüne başladı. 5 yıl sonra da Muhsin Ertuğrul’un tavsiyesi ile Ankara Devlet Tiyatroları Çocuk Tiyatrosu Bölümünde görev aldı. 1958 yılında Ankara Devlet Tiyatrosunun sanatçı kadrosuna katıldı.

1965 yılında yönetmenliğiniAtıf Yılmaz’ın yaptığı veAjda Pekkan, Erol Taş, Gönül Yazar ile beraber Galatasaray’ın efsane futbolcusu ve Gol Kralı Metin Oktay’la başrolü paylaştığı Taçsız Kral filmiyle sinemaya başladı. Ama sinemadan daha çok tiyatroya önem verdi. Yedi Kocalı Hürmüz adlı müzikalde Hürmüz rolü ile başrolde oynadı.

1988’de Devlet Sanatçısı olan Ayten Gökçer, pek çok ödül kazandı. Oyuncu arkadaşları Güven Hokna ve Melek Baykal’la çok sık beraber oluyor.

Ayten Gökçer, 1962 yılında tiyatro oyuncusu Cüneyt Gökçer ile tanıştı 1964 yılında evlendi. Aslı Gökçer (Oba) adında kızı vardır.

Eşi tiyatrocu Cüneyt Gökçer 23 Aralık 2009 tarihinde vefat etti.